Lebih dari 160 penerbangan dibatalkan dan hampir 325 tertunda hingga Minggu malam, menurut FlightAware. Dewan Keselamatan Transportasi Nasional (NTSB) mengirim tim yang dipimpin Ketua Jennifer Homendy untuk menyelidiki.
Amazon dalam pernyataan mengatakan akan bekerja sama dengan penyelidikan.
"Kami sangat berduka mengetahui lima orang kehilangan nyawa dalam insiden hari ini di Bandara Internasional Miami," kata perusahaan.
"Simpati terdalam kami untuk keluarga, orang terkasih, dan semua yang terkena dampak kehilangan yang menghancurkan ini."
Ahli keselamatan penerbangan Steve Arroyo mengatakan pesawat kargo 767 seperti ini biasanya hanya diawaki pilot dan kopilot untuk penerbangan domestik.
Pilot ketiga ditambahkan untuk penerbangan internasional, dan penerbangan internasional jarak jauh membutuhkan pilot keempat.
Arroyo, pensiunan pilot United Airlines, ingin tahu apakah pesawat Amazon mendarat di zona pendaratan landasan pacu. Jika melampaui area itu, mengapa tidak membatalkan pendaratan dan mencoba lagi.
Biasanya, zona pendaratan berada dalam 3.000 kaki (914 meter) pertama landasan pacu.
"Apakah pesawat mendarat di dalam zona pendaratan yang disyaratkan? Jika ya, apa yang terjadi?
Apakah terkait cuaca atau mekanis?" tanya Arroyo.
"Jika mendarat di luar zona pendaratan, mengapa tidak melakukan go-around? Itu praktik standar di seluruh dunia."
Jackson Lee, yang memiliki toko elektronik dekat lokasi kecelakaan, pergi keluar dengan empat rekannya setelah kecelakaan dan melihat asap mengepul di dekat pagar bandara.
"Kami mendengar pesawat lepas landas dan mendarat setiap lima menit. Saya pikir saya sudah terbiasa," kata Lee.
"Saya tidak pernah berpikir ini bisa sedekat ini dengan kami."